Todos los fósiles, sean formas intermedias o no, representan especies (mayormente extintas). No me queda claro por qué Andy parece pensar lo contrario. En cuanto a lo que la similitud de diferentes fósiles entre sí podría "demostrar", creo que esta pregunta demuestra que Andy, como tantos anti-evolucionistas, no entiende la historia de la teoría evolutiva y cómo funciona, tanto esta como la ciencia en general.
La evolución (descendencia común con modificación) no fue alguna idea que Darwin inventara de la nada y que luego buscara formas de probar. No fue así como sucedió. Lo que él hizo fue tomar todos los hechos/observaciones entonces conocidos (recolectados por otros científicos de la época que, en su mayoría, eran creacionistas) e intentar explicarlos de la manera científica que hoy consideraríamos adecuada (una manera que fuera comprobable, no que apelara a agencias sobrenaturales).
En este caso particular, era bien conocido por los geólogos y paleontólogos (de nuevo, casi todos ellos creacionistas) mucho antes de que Darwin escribiera El origen de las especies que existía un patrón de cambio en el registro fósil; cuanto más atrás se iba en el registro, más diferentes eran los animales representados de los que vivían hoy. También era bien conocido que existían fósiles de animales que parecían intermedios en forma entre tanto diversos grupos fósiles como grupos fósiles y vivos.
Ni el patrón del registro fósil ni la existencia de formas fósiles intermedias eran consideradas controversiales entre los científicos de la época; simplemente incorporaron estos hechos a su marco creacionista (mayormente a través de formas de creacionismo progresista de la Tierra vieja). Darwin ofreció una explicación alternativa para estos hechos que no dependía de lo sobrenatural. Por lo tanto, la pregunta no es qué "demuestran" las formas intermedias en el registro fósil (o el patrón del registro fósil), sino cómo explicamos la existencia de formas intermedias en el registro fósil (y el patrón del registro fósil)?
La evolución es la mejor explicación científica actual para esta evidencia, así como para la de muchos otros campos biológicos. Lo que tienden a hacer los anti-evolucionistas modernos es simplemente negar que la evidencia exista en lugar de intentar explicarla científicamente. Pero entonces usualmente están haciendo apologética para sus creencias sectarias, no ciencia.
En cuanto a la afirmación de Andy de que no hay "evidencia de que esas criaturas particulares vinieran de otra", esto no es exactamente correcto. Hay evidencia (véanse las muchas preguntas frecuentes en el archivo), pero no hay prueba absoluta (no existe tal cosa como prueba absoluta en la ciencia). Es cierto que no hay forma de saber con certeza si una especie fósil dio directamente origen a otra (no podemos hacer pruebas de ADN en fósiles). Pero nuevamente es la pregunta incorrecta. Como antes, la mejor pregunta es: cuando tenemos una serie de animales fósiles que gradúan de una forma a otra, ¿cómo explicamos esto científicamente? [Nota: "Así fue porque a Dios le pareció bien hacerlo así", no es una explicación científica]
A continuación llegamos a la extraña afirmación de Andy sobre "algo con medio corazón". A menudo es difícil saber exactamente qué quieren decir los anti-evolucionistas cuando dicen cosas como esta ("¿dónde está la mitad de una ala?" es un refrán común). ¿Está Andy buscando evidencia de un animal con un corazón que parece haber sido cortado por la mitad con un cuchillo? ¿Un corazón que está medio hecho? ¿Qué?
Si está buscando formas más simples, pero aún funcionales, que las que se encuentran en humanos (y otros mamíferos), hay muchas de esas. Basta consultar un libro de texto sobre anatomía comparada de vertebrados. Los cocodrilos, por ejemplo, tienen un corazón algo intermedio entre el corazón de tres cámaras 'reptiliano' y uno de cuatro cámaras aviar. Además, los corazones de vertebrados avanzados, como mamíferos y aves, crecen desde uno simple a uno más complejo durante el desarrollo embrionario. Por lo tanto, a través de la anatomía comparada y la embriología podemos ver evidencia de cómo pudo haber evolucionado este órgano.
Finalmente vemos la profunda confusión de Andy sobre cómo funciona la evolución en la afirmación: "Los únicos hallazgos son nuevas especies que los evolucionistas usan para su 'evidencia'. Usualmente, estas son o una especie u otra, no ambas."
¿Qué debemos hacer con esto? Andy parece pensar que una especie intermedia entre dos otras debe ser literalmente mitad de una especie y mitad de la otra. Eso no es cómo funciona la evolución en absoluto. De nuevo, todas las especies, sean intermedias o no, son sus propias especies completamente formadas y funcionales. No son monstruos a medio formar que las caricaturas de los anti-evolucionistas llevarían a uno a creer.