Parabéns por encher tanto mal-entendido e desinformação em um parágrafo tão curto.
O registro fóssil está longe de ser único em sua formação. Quando você examina o ambiente geológico dos fósseis, pode ver várias maneiras pelas quais os fósseis se formam. A única semelhança é que algo acontece para impedir a escavação e a decomposição. Geralmente, isso é um sepultamento rápido, que pode acontecer de várias maneiras, como a deposição de sedimentos na foz de um rio após uma tempestade, o colapso de uma margem de rio íngreme, cinzas vulcânicas de uma erupção próxima ou sepultamento por areia em uma tempestade de vento. A fossilização também ocorre por sepultamento lento quando outras condições impedem a decomposição, como um pântano de turfa, águas anóxicas em um lago profundo ou seiva de árvore (que pode se transformar em âmbar ao longo do tempo). Finalmente, algumas outras condições incomuns, como as poças de asfalto de LaBrea, podem preservar fósseis. Todas essas diferentes condições são facilmente detectadas olhando para as rochas onde os fósseis são encontrados. E todas essas condições são normais; todas ainda estão acontecendo hoje.
Existem grandes números de fósseis por uma razão simples: os fósseis têm sido criados continuamente por centenas de milhões de anos. Muitos também foram destruídos pela erosão, mas toneladas ainda restam. No entanto, a preservação não é aleatória, então temos zilhões de indivíduos preservados em algumas espécies e poucos ou nenhumos em outras.
Fósseis transicionais não são suposições. Muitos fósseis existem que são intermediários entre outros fósseis tanto em forma quanto em tempo. (Você provavelmente já viu o Índice de Fósseis Vertebrados Transicionais.) Você pode discordar da conclusão de que esses fósseis transicionais indicam descendência comum, mas chamar os fósseis de suposições é negar a realidade fria e dura.
As plantas não evoluíram para se tornarem animais. Em vez disso, plantas e animais evoluíram de um ancestral comum. Esse ancestral era quase certamente unicelular e viveu há alguns bilhões de anos. Existem cerca de 250.000 espécies de plantas com flores, mais um número menor de plantas sem flores. Se cada espécie se diversificasse em duas outras a cada 6 milhões de anos, a diversidade que vemos hoje poderia ser produzida em apenas cerca de 100 milhões de anos. Faça as contas. Concedendo que uma taxa uniforme de diversificação não é um modelo realista, como a especiação pode ocorrer muito mais rápido do que 6 milhões de anos, as contas mostram que a evolução de "muitas" espécies não é irrazoável. Oh, o fóssil mais antigo conhecido de uma planta com flores tem cerca de 140 milhões de anos.
Não todas as espécies no registro fóssil estão extintas. Ginkgo biloba é um contraexemplo.
Mudança evolutiva é observada repetidamente e rotineiramente. Veja 29 Evidências para Macroevolução: Parte 5, Mudança e Mutabilidade. A única farsa sobre a mariposa na Grã-Bretanha é toda a falsidade sendo espalhada sobre ela por Jonathan Wells e outros. (Veja Ícone da Obscurecimento.) Existem dezenas de exemplos de seleção natural além da mariposa-do-papel, e os próprios criacionistas admitem a realidade da microevolução e seleção natural que a mariposa exemplifica. O que eles não apreciam é que as taxas de mudança que vemos na microevolução são tipicamente ordens de magnitude maiores do que as taxas de mudança que vemos no registro fóssil ao longo do tempo geológico.
Relações simbióticas evoluem gradualmente. Não estou muito familiarizado com seu exemplo de cacto/morcego, mas o que provavelmente aconteceu é que o cacto e o morcego evoluíram em algum momento no passado, e a simbiose entre eles evoluiu depois, por graus. Você pode ver estágios intermediários de tal simbiose em yucas e mariposas de yuca. Com algumas espécies, a relação é obrigatória; a yuca morreria sem o morcego e vice-versa. Com outras espécies, as mariposas preferem uma espécie de yuca, mas podem viver de outras; e a yuca recebe a maior parte, mas não toda, sua polinização de uma espécie de mariposa. Ainda outras espécies, as mariposas e yucas não mostram grande preferência por uma espécie em particular.